بزرگ ترین معضل شهرک صنعتی مبارکه، نبود آب آشامیدنی است. فرماندار شهرستان مبارکه با بیان این مطلب گفت:در حال حاضر برخی از شرکت های شهرک صنعتی مبارکه به دلیل نبود آب آشامیدنی سالم، به حالت نیمه تعطیل درآمده اند و حتی ممکن است در کنار آن، مشکلات بهداشتی برای شهرک ایجاد شود. علی اصغر ذاکری هرندی افزود: از مالکان زمین های واقع در مسیر انتقال آب درخواست می شود تا با همکاری شرکت شهرک های صنعتی، توافق لازم در باره انتقال آب از زمین های خود را انجام دهند و شرکت شهرک های صنعتی نیز رضایت مالکان را جلب کند. وی با اشاره به طرح انتقال آب به شهرک صنعتی مبارکه بیان داشت: در این طرح، 15 لیتر آب آشامیدنی در ثانیه به شهرک صنعتی مبارکه و ناحیه صنعتی دهسرخ منتقل می شود. ذاکری ادامه داد: از این مقدار، 12 لیتر به شهرک صنعتی و سه لیتر به ناحیه صنعتی دهسرخ تعلق دارد. وی افزود: این طرح با اعتبار 82 میلیارد ریال و با همکاری شرکت آب و فاضلاب استان اصفهان اجرا می‌شود و بخشی از این هزینه را، صنعتگران این شهرک‌ها و بخشی را شرکت شهرک‌های صنعتی استان اصفهان تأمین می‌کنند. فرماندار مبارکه گفت: یکی از بزرگ ترین چالش های شهرک صنعتی مبارکه، آب مصرفی است که با وجود فعالیت بیش از 400 واحد صنعتی در آن، تاکنون تأمین نشده است.