دادستان تهران در بيان مصداقي از هجمه‌هاي ايراد شده به قوه قضائيه در جريان رسيدگي به پرونده‌هاي فساد، با اشاره به نامه اخير محمود احمدي نژاد درباره بازداشت حميد بقايي اظهار داشت: آقايي که در گذشته مسئوليت داشته، نامه‌اي متضمن مطالب توهين‌آميز و کذب عليه قوه قضائيه و بازپرس پرونده انتشار داده که صرف نظر از مجرمانه بودن مفاد اين نامه و محفوظ بودن حق تعقيب قضائي توسط دادستاني تهران صرفاً در يک بخش از نامه که متضمن ادعاهايي راجع به چگونگي نگهداري متهم در زندان و رعايت حقوق قانوني وي بود، دستور بررسي به وزارت اطلاعات صادر شد.

در پي پاسخ وزارت اطلاعات، جعفري دولت‌آبادي توضيح بيشتري در اين زمينه ارائه داد، مبني بر اينکه ادعاهاي نويسنده نامه که به نقل از متهم آورده است، به گونه اي بود که گويا اين متهم را در زندان «هارون‌الرشيد» يا «گوانتانامو» نگه داشته‌اند! و مدعي شده است که به او اجازه خريد غذا از خارج زندان داده نشده و در انفرادي بوده و رنگ آفتاب را نديده است.

دادستان تهران با اشاره به لايحه متهم مذکور که در تاريخ 17 شهريور سال 1394 ضمن مخالفت با انتقال خود به بند عمومي، تصريح کرده است «بنده در بند فعلي مشکلي ندارم و خواهشمند است من را به بند قبلي برگردانيد» اظهار داشت: اين خواسته متهم بوده و اکنون حامي وي مدعي شده است که او در انفرادي نگهداري مي‌شده است.

جعفري دولت آبادي بخشي از نتيجه تحقيقات وزارت اطلاعات پيرامون ادعاهاي مندرج در نامه‌ منتشره به نقل از متهم را قرائت کرد و از جمله به ادعاي فراهم نبودن امکان تهيه غذاي مناسب از خارج زندان اشاره کرد و گفت: طبق گزارش واصله، حسب درخواست متهم، ناهار و شام از خارج زندان تهيه و تحويل شده و به علاوه غذاي رژيمي براي زنداني پيش‌بيني شده بود و علاوه بر آن، برخي مايحتاج ديگر براي او خريداري و... در اختيار متهم قرار داده مي‌شده است.

دادستان تهران با اشاره به ادعاي ديگري که در نامه مذکور مطرح شده، شامل در اختيار نبودن امکانات درماني براي متهم، اظهار داشت: حسب گزارش وزارت اطلاعات در مواردي که متهم به معاينه پزشکي و حضور پزشک نياز داشته در تمام ساعات شبانه‌روز اين امکان براي او فراهم بوده و سوابق پزشکي وي در زندان موجود بوده که مؤيد کذب بودن اين ادعاست.