بقايي بر خلاف شعارهاي چند ساله تيم احمدي نژاد عليه مذاکرات هسته اي، توافق و برجام، حالا در پاسخ به پرسشي تلگرامي که «بعد از پيروزي در قبال برجام چه رويکردي خواهيد داشت؟» ضمن نقدي به آن، اما تأکيد کرد که به اجراي آن پايبند خواهد بود. او نوشته است: «در مورد برجام بايد دو نكته مهم را از هم تفكيك كرد: 1- برجام به تأييد دولت، مجلس ومقام معظم رهبرى رسيده است و اكنون عليرغم وجود نقدهاى جدى محتوايى و رويه اى به آن، به عنوان يك سند بين المللى شناخته شده و پايبندى به آن اجتناب ناپذير است. لذا همانطور كه رهبر معظم انقلاب تصريح كرده اند جمهورى اسلامى ايران، مادام كه طرف ديگر آن را نقض نكند بر آن پايبند است. لذا اينجانب نيز بر اجراى مفاد آن پايبند خواهم بود و وظيفه اصلي خود را در صورت پيروزي در انتخابات رياست جمهوري، پيگيري دقيق و مطالبه كامل تعهدات طرف هاي غربي كه در بـرجام به عهده گرفته اند مي دانم. 2- بـرجام قادر نبوده است منويات ملت ايران را تأمين كند. انتظار بحق مردم اين بوده است كه برجام تحريم هاى بين المللى و به ويژه تحريم هاى يكجانبه اعمالى آمريكا (كه مصداق بارز و بـرجسته قلدرى، اجحاف و تضييع حقوق ملت ايران و نيز طرف هاى همكارى هاى اقتصادى و بازرگانى با ايران است) را لغو نمايد. اين انتظار برآورده نشد و تمديد ده ساله جديد تحريم ها (آن هم پس از تصويب برجام) و عدم پيگيرى حقوقى دولت نشان مى دهد كه انتظار از برجام براى حل مشكلات كشور منطقى نيست.»